1683-1706
O terceiro filho do rei João IV de Portugal e de Dona Luísa de Gusmão, foi Senhor da Casa do Infantado e cognominado de O Pacífico, porque foi sob a sua regência que se fez a paz com a Espanha (em 1668): assinou um tratado com Carlos II, rei de Espanha, pelo qual findava a Guerra da Restauração que durou cerca de 28 anos.
Regente de 1667 a 1683, governou portanto de facto de 1667 a 1706. Implacável com o irmão, além de o encarcerar em Sintra, deflagrou processo de anulação do casamento com Maria Francisca Isabel de Sabóia, alegando a não-consumação, por inaptidão do rei em sua relação com mulheres, obtendo de Roma e dissolução e casando-se com a cunhada.Feita a paz, a guerra voltou pouco depois aos desejos do novo rei: a Guerra da Sucessão, motivada pelo facto do rei de Espanha, Carlos II, morrer sem deixar sucessor. Para além de Pedro II, os pretendentes eram o Arquiduque Carlos da Áustria, e Filipe de Anjou, neto do rei de França Luís XIV.